工厂化循环水养殖系统是以工业化手段主动控制水环境，水资源消耗小、占地少、对环境污染小、产品优质安全、bing害少、密度高、养殖生产不受地域或气候的限制和影响，资源利用率高，是高投入高产出，低风险实现水产养殖业可持续发展的重要途径。机械过滤系统 机械过滤系统的主要功能就是通过不断的循环，将水中鱼类的粪便及多投的饲料等固体颗粒及胶体状物质过滤分离出去。以避免它们留在养殖水体中继续分解成对水生生物有毒的氨氮等物质。 机械过滤系统设备分很多种，常见的有微滤机、蛋白质分离器、过滤沙缸、精密过滤器等。微滤机经过水产设备的精心设计，早已实现全自动化。
水霉病对水产动物没有选择性，凡是受伤的都有被感染的可能，水霉菌是腐生性的，它不感染健康无伤的鱼。因为活细胞具有“抗霉s”，“抗霉s”很可能存在于黏液分泌细胞所分泌的黏液中，细胞一死，就停止分泌黏液，水霉菌孢子很快寄生上去。疾病早期基本没有症状，当肉眼能发现症状时候，菌丝已经在伤口侵入并向外长出外菌丝，似灰白色的绵毛状，俗称“生毛”或白毛病。霉菌可以分泌大量的蛋白酶，机体受刺激后能分泌大量的粘液。
保持水深在40～80厘米。氨氮含量小于每升0.2毫克，溶氧大于每升5毫克，保持水质清新。光照强度500～2000勒克斯，光照均匀。根据要求调节水温和换水量。养殖过程需按时测定水温、pH值、溶解氧、盐度、COD、氨氮、亚硝/酸盐、硝/酸盐、磷S盐等相关指标，将各项指标控制在合适的范围内。当水温高于20℃时，需要加大地下低温海水的添加量和循环水量，并采取加大纯氧供给量的措施，使氧气饱和度达到100～150%（有液氧设施）。由于夜晚时间比较长，也是鱼类生长速度比较快的时段，因此每天傍晚要坚持清洁养殖池一次，并进行一次池底排污操作，给鱼苗创造一个良好生长的环境。