在目前的发展水平下，循环水养殖模式较高的准入门槛使得循环水养殖与普通低附加值鱼类无缘，而名贵海水鱼类可养殖品种有限，限制了循环水养殖模式的发展。近些年来，经过专家学者和众多的养殖企业的不断探索，国内循环水养殖品种的丰富度大大提高，如：斑石鲷、墨瑞鳕鱼、黄条鰤等。循环水养殖系统既是一个复杂的系统工程，又是一个矛盾的综合体，因此，不可能存在一种十全十美、适用于所有养殖品种的循环水养殖系统，只要不出现明显的设计漏洞，系统运行过程中遇到的很多问题，可以通过系统管理技术和养殖技术来解决。
在低盐度或淡水中养殖凡纳滨对虾时，必须对虾苗进行淡水驯化。在育苗室淡化速度每日盐度降低不超过5，降至5时便可直接向微盐池塘中放苗。在淡水池养殖，应选择在盐度1以下水中稳定培育3天以上的虾苗，亦可先向池塘内加入20～30厘米的淡水，再用出盐前的卤水或海水素（精）调节至适宜的盐度放养虾苗，经数日暂养后，再逐日加入淡水。除直接放养外，尚可对幼小的虾苗进行中间培育，其好处是放养大规格虾苗的成活率较稳定，便于养成期的管理，而且可以延长养殖期，在露天池尚达不到放养水温时，可先将虾苗放在有塑料大棚或其它升温条件的池内暂养一个时期，待露天池水温上升后再分池养殖以延长养殖期。中间培育的放苗密度可是养殖池的3～5倍。
我国苗种繁育过程的全人工控制技术尚处于起步阶段，低营养条件下的生物膜培养技术、水质的智能化控制技术、不同特性鱼卵孵化设施技术、繁育过程智能化判别技术等需要突破，繁育生态环境人工控制技术需要优化和集成。有必要针对我国大宗养殖产品和一些名特优品种的苗种繁育要求，应用现代水环境控制技术和孵化繁育生境模拟技术，构建特定的设备系统，形成完善的养殖生产工艺，达到水环境有效控制、孵化过程有效调控、节能节水以及反季节工业化生产的目的。