养殖水质量好的会减少细菌的滋生，从而减少疾病的发生，养殖水质量差的容易滋生细菌和寄生虫，从而导致疾病爆发。维持水体环境平衡何其艰难，天气的突变、人为操作不当、机器故障等因素都会破坏水体的环境，导致养殖水质量变差，从而引发一系列问题。广州环控农业生物科技有限公司就如何维持水体环境、提高养殖水质量方面花了大量的时间去研发，为了能够更有效、更科学、更环保去进行水产养殖。目前已取得不错成效，很多客户采用了广州环控研发的循环水养殖设备、循环水养殖系统、生物絮团养殖系统、集装箱养鱼设备后，养殖产品不仅质量提高了，产量也提高了，养殖周期缩短了。
在藻类生长所需的大量元素中，磷、氮通常是水体浮游植物增长的限制性因子，总氮大于1.2毫克/升、总磷大于0.11毫克/升时水体开始富营养化，在淡水中当总磷小于0.1毫克/升时藻类生长发展为磷限制。而过高的磷输入如总磷为1.65毫克/升，并不能促进藻类生长。要培养出养殖所需要的有益藻、抑制蓝藻、裸藻等有害藻，我们需要重点关注一些化学指标，总碱度、硬度、盐度、氮、磷、碳以及微量元素钙、铁、锰、锌等有可能成为限制性因子的指标。池塘中的有机质含量可通过检测水中有机耗氧量得知，水中有机质含量高，氮磷的含量也会高，在降氨氮同时可以降低水体有机质含量。
工厂化循环水养殖系统的典型工艺和装备是以物理过滤结合生物过滤为主体，对养殖水体进行深度净化，并集成了水质自动监控系统，实时监测并调控养殖水体质量并可追溯。该系统具有工艺技术完善、水处理效果好、水质状况稳定、生产操作舒适、设备维护简便、运行成本低、系统投资省等优点。这是一套简洁有效的工艺技术路线：鱼池出水自流进入微滤机池，去除残饵和鱼粪等颗粒直径大于60微米的固体悬浮物质，经水泵提升进入生物滤器，一方面截流微小的颗粒悬浮物，另一方面对水体中的氨氮进行降解，净化后的水自流回鱼池。