结合工厂化循环水养殖系统的特点，研究开发出节能环保，占地面积少，土地使用效率高，能有效隔离病害和控制病源的侵入，降低鱼苗的携菌和发病率的封闭式工厂化养殖循环水处理系统：在台风自然灾害较多的南方，工厂化循环水养殖可有效抵御自然灾害对水产养殖业毁灭性的打击。在循环水养殖系统中，重要的就是水质的净化处理，这关乎到水产养殖的成败。目前，传统的循环水养殖系统由于大量电力化设备的使用，能耗特别高，加之部分设备耐腐蚀性差，成为现在做循环水养殖头疼的事情。
20世纪80年代，国外的工厂化循环水养殖设施和技术开始进入中国，当时各地花巨资共引进了西德和丹麦约30余套循环水养殖设施，但由于高昂的投入和运行成本，上述设施很快便被束之高阁。1988年，中国水产科学研究院渔业机械仪器研究所在吸收消化国外技术的基础上，设计了国内第壹个生产性的工厂化循环水养殖车间。随着养殖业和物流的迅速发展，北方冬季的吃鱼问题得到很大改善。随着北方鱼价的大幅下跌，工厂化循环水养殖的经济性受到了严重的质疑，加上技术上的不成熟，工厂化循环水养殖的发展进入了低谷。
工厂化循环水养殖系统是以工业化手段主动控制水环境，水资源消耗小、占地少、对环境污染小、产品优质安全、病害少、密度高、养殖生产不受地域或气候的限制和影响，资源利用率高，是高投入高产出，低风险实现水产养殖业可持续发展的重要途径。工厂化循环水养殖采取集约化生产方式，减少了人力成本，降低了饵料系数。10%的养殖面积产出百分百的产量，这仅仅是其优势之一，更加环保的养殖方式，也提高了养殖品种的品质，可以获得更好的产品售价和经济效益。消费者对高品质的水产品需求日益增长，传统养殖方式产出的水产品没有太多的附加值空间，利润小，风险高，已经很难适应高端消费者的需求。