循环水养殖系统一种新型的养殖模式，也叫工厂化循环水养殖系统、室内循环水养殖系统。是一种通过水处理设备将养殖水净化处理后再循环利用的一种养殖模式。工厂化循环水养殖系统融入了生物学、工程学、流体力学、环境工程学、信息学等多种学科的知识，是一个多学科，多领域技术交叉，具有较强技术含量的系统。工厂化循环水养殖系统是以工业化手段主动控制水环境。
生化模式净水主要是靠硝化细菌，硝化细菌从无到有这个过程俗称挂膜。硝化细菌挂膜需要滤材（细菌屋）；硝化细菌属于好氧细菌，因此需要氧气；硝化细菌繁殖还需要养分，也就是鱼粪。再满足上诉三个情况下，保持25度水温，硝化细菌从无到有需要将近35天，15度水温情况下需要50天或者更久，这个过程叫冷启动。想快速启动，可以使用液体硝化细菌，或者添加一些其他已经挂膜的滤材进来进行引菌，这个过程叫热启动。海水系统应为高盐度的问题，自然挂膜时间比淡水系统要长一倍以上，时间也随盐度升高而延长。
工厂化循环水养殖系统不仅节能节水效果较好，而且还对防止养殖病害发生、实现养殖过程零用药、提高产品质量和经济效益发挥重要的作用。