20世纪80年代，国外的工厂化循环水养殖设施和技术开始进入中国，当时各地花巨资共引进了西德和丹麦约30余套循环水养殖设施，但由于高昂的投入和运行成本，上述设施很快便被束之高阁。1988年，中国水产科学研究院渔业机械仪器研究所在吸收消化国外技术的基础上，设计了国内第壹个生产性的工厂化循环水养殖车间。随着养殖业和物流的迅速发展，北方冬季的吃鱼问题得到很大改善。随着北方鱼价的大幅下跌，工厂化循环水养殖的经济性受到了严重的质疑，加上技术上的不成熟，工厂化循环水养殖的发展进入了低谷。
生化模式净水主要是靠硝化细菌，硝化细菌从无到有这个过程俗称挂膜。硝化细菌挂膜需要滤材（细菌屋）；硝化细菌属于好氧细菌，因此需要氧气；硝化细菌繁殖还需要养分，也就是鱼粪。再满足上诉三个情况下，保持25度水温，硝化细菌从无到有需要将近35天，15度水温情况下需要50天或者更久，这个过程叫冷启动。想快速启动，可以使用液体硝化细菌，或者添加一些其他已经挂膜的滤材进来进行引菌，这个过程叫热启动。海水系统应为高盐度的问题，自然挂膜时间比淡水系统要长一倍以上，时间也随盐度升高而延长。
工厂化循环水养殖的特点：一是用水量少，可利用较低质水源，对水资源要求较低；二是占地少，对土地资源的要求低；三是养殖密度高，单位耗水产量大；四是易于控制生长环境，鱼类（以及其他养殖种类）生长速度快，生长周期短；五是饲料利用率高；六是水循环使用，利用系数高；七是排放的废水废物少，能集中处理，对环境无压力或很小；八是不受外界气候的影响，可实现常年生产。