果树叶片吸进去二氧化碳，呼出氧气；根系吸进去氧气，呼出二氧化碳。果树要想进行正常的营养循环，地表浅层的呼吸根必须具有充足的氧气供应，这就要求土壤具备疏松度和透气性。土壤透气性与土壤颗粒的大小成正比，并受土壤的含水量、温度、大气压力和气温等条件的影响。土壤透气性又叫土壤通气性，也就是土壤空气与大气相互交换的性能，或大气进入土壤的速率。它与土壤结构，特别是与孔隙特性密切相关，总孔隙度或大孔隙比例较高的土壤，具有良好的透气性。如结构良好的土壤透气性比结构不良的土壤好；砂质土比粘质土好；水分含量适中的土壤比过度潮湿的好；表层土壤比下层土壤好等。
生物有机肥的生产工艺主要是其中有机肥从生产原料到半成品的生产工艺。
在生产上主要应用的生产工艺有两种，一种是平面条垛式堆肥工艺，一种是槽式好氧发酵工艺。此外，实验室小规模试制还有采用密封箱/罐式发酵。
1、平面条垛式堆肥工艺。
生产流程：原料处理--加菌--混合--建跺--翻堆--二次加菌--混合--检验--包装--出厂
优点：投资小、工艺相对简单
缺点：占地面积大、腐熟不彻底、二次污染严重。
2、槽式好氧发酵工艺。
生产流程：原料处理--加菌--混合--入槽--翻堆--二次加菌--混合--检验--包装--出厂
优点：腐熟彻底、产品质量高、二次污染小
缺点：设备投入大、投资大
生物有机肥营养元素齐全，为作物提供全面的养分；
生物有机肥有机质含量高，能够改良土壤，改善土壤理化性状，增强土壤保水、保肥、供肥的能力，缓解长期使用化肥造成的土壤板结；
生物有机肥中的有益微生物进入土壤后与土壤中微生物形成相互间的共生增殖关系，抑制有害菌生长并转化为有益菌，相互作用，相互促进，起到群体的协同作用，有益菌在生长繁殖过程中产生大量的代谢产物，促使有机物的分解转化，能直接或间接为作物提供多种营养和刺激性物质，促进和调控作物生长。
生物有机肥提高土壤孔隙度、通透交换性及植物成活率、增加有益菌和土壤微生物及种群。同时，在作物根系形成的优势有益菌群能抑制有害原菌繁衍，增强作物抗逆抗能力降低重茬作物的情指数，连年施用可大大缓解连作障碍。
生物有机肥回收利用农业废弃物，减少环境污染，对人、畜、环境、，是一种环保型肥料。